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Arlequin

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Arlequin是一种自由种群遗传学综合数据分析软件[1],提供GUI界面,以让一般用户也可以作生物群体间的多种测试及计算,例如:遗传分化系数英语Fixation index(Fixation index,亦作F-statistics[2],Fst)、遗传距离哈代-温伯格平衡连锁不平衡成对差测试等[3]

Arlequin由日内瓦大学遗传学与生物统计学实验室开发[4]。现时本软件的最新版本为3.5.2.2,于2015年8月22日以zip压缩及安装档的形式发放[5],只有Windows版本。Mac OS XLinux只提供命令式(3.5.2),而且只限于64-bit环境,分为“arlecore”[6]、“arlsumstat”[7]及说明文件三部分。

外部链接

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  1. ^ Tiago Antao. Bioinformatics with Python Cookbook. Packt Publishing. 25 June 2015: 152 [2019-01-10]. ISBN 978-1-78355-865-0. (原始内容存档于2019-02-15). 
  2. ^ 刘春芳; 李翠; 张振; 王海艳. 中国沿海不同地区泥蚶(Tegillarca granosa)的遗传多样性分析. 海洋与湖沼. 2015-03, 第46卷 (第2期) [2017-01-17]. doi:10.11693/hyhz20140400105. (原始内容存档于2020-10-26) (中文(简体)). 
  3. ^ Dilip K Arora; Randy Berka; Gautam B. Singh. Bioinformatics. Elsevier. 15 August 2006: 86 [2019-01-10]. ISBN 978-0-08-046370-4. (原始内容存档于2019-02-15). 
  4. ^ Michael R. Barnes. Bioinformatics for Geneticists: A Bioinformatics Primer for the Analysis of Genetic Data. John Wiley & Sons. 16 April 2007: 172 [2019-01-10]. ISBN 978-0-470-02619-9. (原始内容存档于2019-02-15). 
  5. ^ Arlequin ver 3.5.2.2 (released on 02.08.2015). 2015-08-02 [2017-01-17]. (原始内容存档于2020-12-29). 
  6. ^ ARLECORE (v 3.5.2) README.txt. 2015-04 [2017-01-17]. (原始内容存档于2020-07-25). 
  7. ^ ARLSUMSTAT (v 3.5.2) README.txt. 2009-12 [2017-01-17]. (原始内容存档于2020-06-13). 

外部链接

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