系統分類學

系統分類學（英語：systematics）是研究物種的演化歷史，以及他與其它物種間的關係的學科，此親緣關係被可視化為具支序的演化樹（別名：系統發生樹，系統發育）。系統發育有兩個組成部分，分支順序（顯示組的關係）和分支長度（顯示進化的量）。利用生物物種在不同的環境，地區進行不同的演化，以基因或是基因產物，也就是蛋白質的資訊，將物種演化的歷史進行解析。比方說形態上的演化傾向等等。

參考文獻

外部連結

Tree of Life （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）

參見

支序分類學 - 一個系統分類學的方法學
全球生物多樣性（英語：Global biodiversity）
表形分類學（英語：Phenetics）
系統發生學 - 生物譜系之間的歷史關係
16S 核糖體RNA - 一個被深入研究的核酸，在系統發生學中很有用
生物分類法和生物分類學 - 系統分類學的研究結果

閱論編演化生物學
生命演化歷程生命史
進化	自然發生生命起源適應輻射適應利他行為（英語：Altruism (biology)）欺騙行為（英語：Cheating (biology)）互惠利他主義鮑德溫效應（英語：Baldwin effect）支序分類學共同進化互利共生共同起源趨同進化趨異進化已知最早生命形式（英語：Earliest known life forms）進化的證據擴展適應絕滅生物集群滅絕同源最後共同祖先宏觀進化微進化進化不匹配（英語：Evolutionary mismatch）非適應輻射（英語：Nonadaptive radiation）生命起源胚種論平行進化信號理論劣勢原則（英語：Handicap principle）物種形成物種複合種物種概念（英語：Species concept）進化分類學（英語：Evolutionary taxonomy）選擇單位（英語：Unit of selection）進化的基因中心論（英語：Gene-centered view of evolution）
群體遺傳學	人工選擇生物多樣性進化穩定對策費雪原理適應度整體適應度基因流動遺傳漂變親屬選擇親代投資親子衝突（英語：Parent–offspring conflict）突變種群自然選擇兩性異形性選擇擇偶社會選擇（英語：Social selection）特里弗斯-威拉德假說（英語：Trivers–Willard hypothesis）遺傳變異
發展	渠道導向（英語：Canalisation (genetics)）進化發育生物學反演（英語：Inversion (evolutionary biology)）模塊化（英語：modularity (biology)）表型可塑性
特定類群的進化	鳥類進化腕足動物（英語：Evolutionary history of brachiopods）頭足綱（英語：Evolutionary history of cephalopods）恐龍魚類（英語：Evolution of fish）真菌（英語：Evolution of fungi）昆蟲（英語：Evolution of insects）蝴蝶（英語：Butterfly evolution）生命哺乳動物（英語：Evolution of mammals）貓（英語：Cat gap）狗（英語：Origin of the domestic dog）馬（英語：Evolution of the horse）人類進化狐猴（英語：Evolutionary history of lemurs）鯨豚（英語：Evolution of cetaceans）海牛（英語：Evolution of sirenians）軟體動物（英語：Evolution of Mollusca）植物（英語：Evolution of plants）爬行動物（英語：Evolution of reptiles）蜘蛛（英語：Evolution of spiders）四足類病毒（英語：Viral evolution）流感（英語：Evolution of Influenza）
特定構造的進化	細胞（英語：Evolution of cells） DNA（英語：Models of DNA evolution）真核生物染色體內膜系統眼睛（英語：Evolution of the eye）鞭毛（英語：Evolution of flagella）頭髮線粒體哺乳動物聽小骨進化神經系統大腦（英語：Evolution of the brain）細胞核色素體
生物過程的進化	衰老（英語：Evolution of ageing）死亡程序性細胞死亡鳥類飛行的起源（英語：Origin of avian flight）生物複雜性的演變 Cooperation（英語：Co-operation (evolution)）彩色視覺（英語：Evolution of color vision）靈長目彩色視覺的進化情緒（英語：Evolution of emotion）同理心倫理學真社會性（英語：Evolution of eusociality）代謝動物一夫一妻制（英語：Monogamous pairing in animals）道德（英語：Evolution of morality）鑲嵌進化（英語：Mosaic evolution）多細胞生物有性生殖的進化異配生殖生物生命週期接合型（英語：Mating type）減數分裂（英語：Origin and function of meiosis）性別決定系統
物種形成	異域物種形成前進進化（英語：Anagenesis）後退進化（英語：Catagenesis (biology)）系枝發生（英語：Cladogenesis）協同物種形成生態物種形成（英語：Ecological speciation）非生態物種形成（英語：Nonecological speciation）雜交成種（英語：Hybrid speciation）鄰域物種形成（英語：Parapatric speciation）邊域物種形成（英語：Peripatric speciation）同域物種形成（英語：Sympatric speciation）華萊士效應
相關領域	生物地理學生態遺傳學族群選擇文化進化文化群體選擇（英語：Cultural group selection）雙繼承理論全基因組進化論（英語：Hologenome theory of evolution）缺失遺傳性問題（英語：Missing heritability problem）分子進化天體生物學系統發生學系統發生樹系統分類學比較解剖學進化心理學進化神經科學原初生命體表觀遺傳跨代繼承
進化思想史	文藝復興和啟蒙運動的進化思想（英語：Evolutionary ideas of the Renaissance and Enlightenment）物種嬗變（英語：Transmutation of species）大衛·休謨《自然宗教對話錄（英語：Dialogues Concerning Natural Religion）》查爾斯·達爾文《物種起源》古生物學史（英語：History of paleontology）過渡化石融合遺傳孟德爾定律達爾文主義的衰落（英語：The eclipse of Darwinism）新達爾文主義現代進化綜論分子進化史（英語：History of molecular evolution）擴展進化綜合理論（英語：Extended evolutionary synthesis）
哲學	達爾文主義達爾文進化論的替代方案（英語：Alternatives to Darwinian evolution）災變論拉馬克主義定向演化突變論（英語：Mutationism）驟變說（英語：Saltation (biology)）結構主義神導演化論活力論
分類共享

閱論編系統發生學
相關領域	計算系統發生學（英語：Computational phylogenetics）分子系統發生學支序系統學生物分類學系統分類學進化分類學（英語：Evolutionary taxonomy）
基本概念	系統發生（分支發生（英語：Cladogenesis））系統發生樹（支序圖）進化網絡長枝吸引效應進化支和進化級（英語：Evolutionary grade）譜系（英語：Lineage (evolution)）（幽靈譜系（英語：Ghost lineage））幽靈種群（英語：Ghost population）
推理方法	最大簡約法機率法（最大似然估計貝葉斯法）距離矩陣法（英語：Distance matrices in phylogeny）（鄰近連接法不加權算術平均連鎖法（英語：UPGMA）最小二乘法（英語：Least squares inference in phylogeny））三元分析（英語：Three-taxon analysis）系統發生包圍法（英語：Phylogenetic bracketing）系統發生和解（英語：Phylogenetic reconciliation）
前沿課題	生物譜系命名法（英語：Phylogenetic nomenclature）（《國際系統發生命名法規（英語：PhyloCode）》） DNA 條碼系統發生比較方法（英語：Phylogenetic comparative methods）系統發生生態位保守性（英語：Phylogenetic niche conservatism）系統發生信號（英語：Phylogenetic signal）系統發生軟件（英語：List of phylogenetics software）系統發生基因組學（英語：Phylogenomics）親緣地理學
類群特徵	原始特徵（英語：Primitive (phylogenetics)）（祖徵／共有祖徵（英語：Plesiomorphy and symplesiomorphy））衍生特徵（衍徵／共有衍徵自有衍徵（英語：Autapomorphy））
類群性質	單系群並系群多系群（複系群）
其他術語	冠群／幹群／泛群（總群）姊妹群（姐妹群）外群基群超樹（英語：Supertree）
相關頁面共享資源

閱論編生物學
背景	生物學史植物學史（英語：History of botany）解剖學史動物學史 (1859年之前)（英語：History of zoology (through 1859)）動物學史 (1859年之後)（英語：History of zoology (since 1859)）植物分類學史（英語：History of plant systematics）古生物學史（英語：History of paleontology）生態學史（英語：History of ecology）模式生物史（英語：History of model organisms）藻類學史（英語：History of phycology）遺傳學史（英語：History of genetics）生物化學的歷史分子生物學史 RNA生物學史（英語：History of RNA biology）分子進化學史（英語：History of molecular evolution）免疫學史（英語：Timeline of immunology）生物技術史（英語：History of biotechnology）
主領域	生物化學分子生物學結構生物學糖生物學蛋白質組學基因組學脂類組學代謝物組學系統生物學細胞生物學生理學植物生理學動物生理學人體生理學生物資訊學免疫學時間生物學進化發育生物學進化生物學發育生物學分子遺傳學胚胎學古生物學解剖學遺傳學細胞遺傳學表觀遺傳學神經科學組織學生物統計學生物分類學植物學動物學真菌學微生物學病毒學寄生蟲學生態學海洋生物學天體生物學流行病學
跨領域	數理生物學生物物理學生物力學量子生物學化學生物學合成生物學生物地理學保育生物學低溫生物學繁殖生物繁殖方式（維基數據所列：Q130077803）
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