甲基紅色桿菌屬
外觀
甲基紅色桿菌屬 | |
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科學分類 | |
域: | 細菌域 Bacteria |
門: | 假單胞菌門 Pseudomonadota |
綱: | α-變形菌綱 Alphaproteobacteria |
目: | 生絲微菌目 Hyphomicrobiales |
科: | 甲基桿菌科 Methylobacteriaceae |
屬: | 甲基紅色桿菌屬 Methylorubrum Green and Ardley 2018[1] |
模式種 | |
扭脫甲基紅色桿菌 Methylorubrum extorquens (Urakami and Komagata 1984) Green and Ardley 2018
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異名[2] | |
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甲基紅色桿菌屬(學名:Methylorubrum)是甲基桿菌科的一個屬。此屬的物種是革蘭氏陰性(或可變)、不產生孢子、氧化酶陽性、過氧化氫酶陽性、脲酶陽性、嚴格需氧的杆狀細菌。此屬的物種細胞尺寸為0.5至1.5×1.0至10.0µm,並且大多數物種以單極、亞極或側鞭毛來運動。該屬的模式種為扭脫甲基紅色桿菌(Methylorubrum extorquens)。[1][3]
詞源
[編輯]「Methylorubrum」一詞由「Methylo-」和「rubrum」組成。前綴「Methylo-」來自拉丁語「methylum」,指甲基自由基,所以「methylo-」表示與甲基自由基有關。「Rubrum」來自拉丁語「ruber」,表示紅色。因此,「Methylorubrum」一詞表示一種利用紅色甲基自由基的微生物。[1]
歷史
[編輯]在甲基桿菌屬被建立之後,物種的數量越來越多。彼得·格林(Peter N. Green)和朱莉·阿德利(Julie K. Ardley)兩人使用16S rRNA基因測試後發現有一部分物種不該被歸類為甲基桿菌屬的物種。2018年,他們二人創建了甲基紅色桿菌屬並把甲基桿菌屬的11個物種移動至該屬。[3]
1984年,原單胞菌屬(Protomonas)被建立。[4]隔年,該屬的唯一物種被整併入甲基桿菌屬(Methylobacterium)。[5]2018年,隨着甲基桿菌屬的重新分類,原先原單胞菌屬的唯一物種也隨着其他物種被納入此屬。因此原單胞菌屬成了此屬的異名。[3]
下屬物種
[編輯]本屬包括以下物種:[1]
- 食胺甲基紅色桿菌 Methylorubrum aminovorans (Urakami et al. 1993) Green and Ardley 2018,前稱多噬耗甲基桿菌、嗜胺甲基桿菌
- 扭脫甲基紅色桿菌 Methylorubrum extorquens (Urakami and Komagata 1984) Green and Ardley 2018,前稱彎曲原單胞菌
- 根際甲基紅色桿菌 Methylorubrum podarium (Anesti et al. 2006) Green and Ardley 2018,前稱根際甲基桿菌
- 極甲基紅色桿菌 Methylorubrum populi (Van Aken et al. 2004) Green and Ardley 2018,前稱極甲基桿菌
- 矢竹甲基紅色桿菌 Methylorubrum pseudosasae (Madhaiyan and Poonguzhali 2016) Green and Ardley 2018
- 羅茲氏甲基紅色桿菌 Methylorubrum rhodesianum (Green et al. 1988) Green and Ardley 2018,前稱羅氏甲基桿菌
- 淺紅甲基紅色桿菌 Methylorubrum rhodinum (Heumann 1962) Green and Ardley 2018,前稱玫瑰色假單胞菌
- 海水甲基紅色桿菌 Methylorubrum salsuginis (Wang et al. 2007) Green and Ardley 2018,前稱海水甲基桿菌
- 芬蘭甲基紅色桿菌 Methylorubrum suomiense (Doronina et al. 2002) Green and Ardley 2018,前稱芬蘭甲基桿菌
- 硫氰酸鹽甲基紅色桿菌 Methylorubrum thiocyanatum (Wood et al. 1999) Green and Ardley 2018,前稱硫氰酸鹽甲基桿菌
- 扎特曼氏甲基紅色桿菌 Methylorubrum zatmanii (Green et al. 1988) Green and Ardley 2018,前稱扎氏甲基桿菌
參考文獻
[編輯]- ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 Genus: Methylorubrum. lpsn.dsmz.de. [2024-05-01]. (原始內容存檔於2022-11-29) (英語).
- ^ Genus: Protomonas. lpsn.dsmz.de. [2024-05-01]. (原始內容存檔於2024-05-01) (英語).
- ^ 3.0 3.1 3.2 Green, Peter N.; Ardley, Julie K. Review of the genus Methylobacterium and closely related organisms: a proposal that some Methylobacterium species be reclassified into a new genus, Methylorubrum gen. nov.. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2018, 68 (9) [2024-05-01]. ISSN 1466-5034. doi:10.1099/ijsem.0.002856. (原始內容存檔於2024-07-09).
- ^ Urakami, Teizi; Komagata, Kazuo. Protomonas, a New Genus of Facultatively Methylotrophic Bacteria. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 1984, 34 (2) [2024-05-01]. ISSN 1466-5034. doi:10.1099/00207713-34-2-188. (原始內容存檔於2024-07-12).
- ^ Bousfield, I. J.; Green, P. N. Reclassification of Bacteria of the Genus Protomonas Urakami and Komagata 1984 in the Genus Methylobacterium (Patt, Cole, and Hanson) Emend. Green and Bousfield 1983. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 1985, 35 (2) [2024-05-01]. ISSN 1466-5034. doi:10.1099/00207713-35-2-209. (原始內容存檔於2024-07-13).
- LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature