脱镁叶绿素(英语:Pheophytin,中国也称为褐藻素)与光合作用中光反应的电子传递链有关。叶绿素在经过加酸或加热或脱镁作用后会变成脱镁叶绿素,颜色也会改变。在水污染的地方,会造成浮游植物细胞破碎死亡时,其原本所含的叶绿素也跟著被破坏,而转变成脱镁叶绿素。因此脱镁叶绿素的含量比例可以作为水质的指标之一。